Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms