Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms