Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLTPP55058 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLTPP55058 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLTPP55058 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms