Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRAP54198 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRAP54198 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRAP54198 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRAP54198 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRAP54198 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRAP54198 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRAP54198 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRAP54198 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRAP54198 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRAP54198 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRAP54198 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRAP54198 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRAP54198 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRAP54198 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRAP54198 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRAP54198 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIRAP54198 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms