Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms