Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC34P49427 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms