Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms