Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A3P48764 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A3P48764 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms