Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTDSS1P48651 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms