Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms