Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNT2P45379 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT2P45379 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms