Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms