Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAEP38570 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms