Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJC1P36383 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJC1P36383 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJC1P36383 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJC1P36383 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJC1P36383 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms