Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C19P33261 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms