Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKARP32238 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCKARP32238 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms