Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPS1P31327 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CPS1P31327 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPS1P31327 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CPS1P31327 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPS1P31327 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPS1P31327 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPS1P31327 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms