Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DNMT1P26358 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms