Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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