Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD247P20963 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD247P20963 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD247P20963 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD247P20963 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CD247P20963 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD247P20963 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD247P20963 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD247P20963 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms