Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB4AP20338 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB4AP20338 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB4AP20338 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms