Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF4P18848 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF4P18848 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms