Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XBP1P17861 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XBP1P17861 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
XBP1P17861 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XBP1P17861 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XBP1P17861 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms