Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPGDP15428 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPGDP15428 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms