Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRF1P14222 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRF1P14222 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRF1P14222 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms