Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGAP10645 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHGAP10645 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHGAP10645 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHGAP10645 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms