Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms