Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms