Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms