Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1O95476 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms