Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPINO95295 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms