Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP2O95045 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP2O95045 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP2O95045 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPP2O95045 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPP2O95045 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UPP2O95045 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UPP2O95045 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPP2O95045 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP2O95045 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms