Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CIAO1O76071 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIAO1O76071 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms