Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK2O60296 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms