Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DENRO43583 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DENRO43583 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DENRO43583 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DENRO43583 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms