Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD28O15084 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD28O15084 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms