Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms