Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms