Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms