Protein–RNA interactions for Protein: A6NN06

Putative UPF0633 protein MGC21881, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NN06 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A6NN06 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A6NN06 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
A6NN06 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms