Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms