Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C5orf60A6NFR6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms