Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HELTA6NFD8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms