Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE3A1L190 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms