Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPQ1

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPQ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A1W2PPQ1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms