Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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