Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PGM2L1-201ENST00000298198 8515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP000997.2-201ENST00000564619 8400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC078846.1-201ENST00000608694 7083 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLC6A4-201ENST00000261707 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DZIP1-202ENST00000361156 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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