Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL390195.2-201ENST00000564771 2023 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SMG9Q9H0W8 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms