Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC8.79□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms