Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms